Cục Hải quan mới đây đã ban hành hướng dẫn về việc xử lý tờ khai và cập nhật thuế suất theo Nghị định số 199/2025/NĐ-CP của Chính phủ. Nghị định này sửa đổi, bổ sung Nghị định số 26/2023/NĐ-CP về Biểu thuế xuất khẩu, Biểu thuế nhập khẩu ưu đãi và các quy định liên quan đến Danh mục hàng hóa cũng như mức thuế tuyệt đối, thuế hỗn hợp và thuế nhập khẩu ngoài hạn ngạch thuế quan.
Mục đích chính của nghị định là điều chỉnh mức thuế suất thuế xuất khẩu và thuế nhập khẩu ưu đãi đối với một số mặt hàng, đồng thời bổ sung chính sách ưu đãi mới cho ngành sản xuất và lắp ráp ô tô. Nghị định đã tăng mức thuế xuất khẩu đối với một số mặt hàng quan trọng. Chẳng hạn, mức thuế suất đối với Phospho vàng sẽ tăng từ 5% hiện hành lên 10% từ ngày 1/1/2026 và lên 15% từ ngày 1/1/2027. Ngoài ra, mức thuế nhập khẩu ưu đãi 0% đối với tấm thép đen cán để tráng thiếc chỉ được duy trì đến hết tháng 8/2025, sau đó sẽ tăng lên 7% kể từ ngày 1/9/2025.
Một điểm đáng chú ý khác trong Nghị định là việc bổ sung quy định về áp dụng thuế ưu đãi cho doanh nghiệp sản xuất và lắp ráp xe ô tô sử dụng nhiên liệu thân thiện môi trường. Theo đó, các doanh nghiệp sản xuất và lắp ráp ô tô sử dụng nhiên liệu xăng, dầu nếu đồng thời sản xuất các dòng xe thân thiện môi trường như xe ô tô chạy điện, xe sử dụng pin nhiên liệu, xe hybrid, xe sử dụng nhiên liệu sinh học hoàn toàn hoặc xe sử dụng khí thiên nhiên sẽ được phép cộng hợp sản lượng của các dòng xe xanh này vào sản lượng chung tối thiểu và sản lượng riêng tối thiểu của từng nhóm xe xăng, dầu tương ứng khi xét hưởng ưu đãi thuế.
Quy định này giúp các doanh nghiệp sản xuất và lắp ráp ô tô có chiến lược chuyển dịch sang xe xanh – vốn thường có sản lượng thấp trong giai đoạn đầu – vẫn đủ điều kiện được hưởng các ưu đãi thuế nhập khẩu linh kiện theo chương trình ưu đãi. Nghị định cũng cho phép doanh nghiệp sở hữu trên 35% vốn điều lệ tại một hoặc nhiều công ty sản xuất, lắp ráp ô tô được cộng gộp sản lượng xe của các công ty này để tính sản lượng tối thiểu xét hưởng ưu đãi.
Để triển khai thực hiện Nghị định số 199, Cục Hải quan đã có văn bản chỉ đạo các Chi cục Hải quan khu vực nhanh chóng tra cứu và phổ biến nội dung Nghị định. Các cán bộ, công chức và doanh nghiệp sẽ được hướng dẫn thực hiện đầy đủ và đúng quy định khi làm thủ tục hải quan. Mức thuế suất mới đã được cập nhật trên hệ thống VNACCS/VCIS và sẽ tự động áp dụng từ ngày 13/7/2025.
Đối với các tờ khai xuất nhập khẩu phát sinh từ ngày 8/7 đến trước 13/7/2025 nếu có thay đổi mức thuế theo Nghị định, các Chi cục Hải quan sẽ hướng dẫn doanh nghiệp khai báo bổ sung và xử lý thuế kịp thời theo quy định. Trường hợp phát sinh vướng mắc trong quá trình thực hiện, yêu cầu gửi phản ánh qua Ban Nghiệp vụ thuế hải quan (Cục Hải quan) để được hỗ trợ xử lý.
